Trends in Microbiology | 科学家强调构建微生物组生物库基础设施的必要性

近日Trends in Microbiology发表了题为Development of Microbiome Biobanks – Challenges and Opportunities的综述论文，由英国CABI的Matthew Ryan博士领导的一个科学家团队概述了微生物组（包括细菌、古菌、真菌、藻类、原生动物和病毒在内的生物群落）"储存"的一系列机遇与挑战。研究人员呼吁从科学、经济、社会和环境的角度出发，列出一份应该优先保护的清单，提出目前的生物库基础设施是零散的，没有为微生物组的保存做好准备。技术的快速发展迫切需要评估生物库如何通过保存微生物组样本及其功能潜力来支撑研究。

生物库保存了传统上作为单一生物体或无菌培养物保存的生物样本。生物库对于确保高质量的研究是必不可少的，对于如何将研究成果用于现实世界的应用，例如指导公共卫生政策或开发产品，生物库就像一个故障保护装置。研究人员在欧盟项目MicrobiomeSupport对资源基础设施需求进行评估后认为，微生物组科学标志着科学方法的模式转变，从保存培养物集合中的无微生物样品（如种子样品）转向保存复杂的群落，这就需要开发支持性的基础设施。

图1.欧洲和国际微生物组研究的现状。目前欧洲和国际上支撑微生物组研究的格局是零散的。

生物库是保证研究成果在公共领域得到更好应用的一种方式，也是科学家在必要时对其工作进行独立验证的一种方式。生物库对于生物多样性的保护也是至关重要的，因此，生物库的必要性和紧迫性是肯定存在的。为什么要保存和保存什么的问题必须从科学、经济、社会和环境的角度详细解决。考虑到不同环境下微生物组的多样性和复杂性，应商定一个优先级清单，以集中力量，取得进展。最大的技术瓶颈是开发优化的微生物组保存方法和评估保存成功的方法，以保持微生物组的组成和功能。培养物收集和生物库之间具有明显的互补性，因此有必要采取一种方法，使两者能够共同合作，以确保这一关键的微生物组研究领域得到有效支持。

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